如果学校扣留学费，可参考以下方法来处理：
沟通协商
- 与学校相关部门沟通：尝试与学校的财务部门、教务处或学生管理部门等进行友好且理性的沟通，清晰地表达自己的诉求，询问学校扣留学费的原因，了解是否存在误解、财务流程问题或其他特殊情况。在沟通时，注意保留好聊天记录、通话录音等。
- 查看合同或协议：仔细查看入学时与学校签订的合同、协议或学校的相关规章制度，确认其中关于学费缴纳、退还以及相关情况的规定，看学校的扣留学费行为是否符合约定。
- 书面致函：若口头沟通效果不佳，可以考虑以书面形式向学校发送函件，如电子邮件、挂号信等，再次阐明自己的立场和诉求，要求学校在一定期限内给予明确答复和解决方案，并保留好发送凭证。
寻求外部帮助
- 向教育行政部门投诉：如果与学校沟通后未能解决问题，可向学校所在地的教育行政部门进行投诉。准备好详细的材料，包括缴费凭证、与学校的沟通记录、相关合同协议等，说明学校扣留学费的具体情况和自己的诉求，请求教育行政部门介入调查和协调。
- 求助消费者协会：学生作为教育服务的消费者，在学校存在不合理扣留学费等侵害消费者权益的行为时，也可以向当地的消费者协会进行投诉。消费者协会会根据相关法律法规，对学校的行为进行调查和调解。
- 寻求媒体监督：可以向一些有影响力的媒体反映情况，借助媒体的力量来促使学校重视并解决问题，但要确保所提供的信息真实准确。
法律途径
- 咨询律师：咨询专业律师，向其详细介绍情况，律师会根据具体情况分析学校的行为是否合法，以及学生拥有哪些权利和可行的法律措施。
- 申请仲裁：若学校与学生之间存在教育服务合同关系，且合同中有仲裁条款约定，可以根据合同约定向仲裁机构申请仲裁。
- 提起诉讼：如果其他途径都无法解决问题，可以向法院提起民事诉讼。准备好起诉状、证据等材料，向学校所在地的法院起诉，要求学校退还被扣押的学费及可能产生的利息等，并承担相应的法律责任。