甲沟炎交叉感染是比较棘手的情况，以下是一些常见的治疗方法：
局部治疗
清洁消毒
首先要使用温和的肥皂水或医用碘伏对感染部位进行清洁。例如，用碘伏浸湿棉球，然后轻轻擦拭甲沟炎周围的皮肤，每天可以进行 3 - 4 次，这样可以去除表面的污垢和细菌，防止感染进一步加重。
药物敷用
根据感染的病原体类型，可以选择合适的药物进行外敷。如果是细菌感染，可使用抗生素软膏，如莫匹罗星软膏。将适量的软膏均匀涂抹在患处，然后用无菌纱布轻轻包扎，每天更换 1 - 2 次。这样能使药物持续作用于感染部位，抑制细菌生长。
若是真菌感染引起的交叉感染（在一些潮湿环境下，真菌容易滋生并交叉感染甲沟炎），则可以使用抗真菌药物，如克霉唑乳膏。使用方法与抗生素软膏类似，不过抗真菌治疗通常需要持续较长时间，一般至少 2 - 4 周，因为真菌比较顽固。
口服药物治疗
抗生素治疗
如果甲沟炎交叉感染比较严重，出现了红肿、疼痛加剧，甚至有发热等全身症状，可能需要口服抗生素。常用的有阿莫西林 - 克拉维酸等。不过抗生素的使用需要在医生的严格指导下进行，医生会根据感染的细菌类型和患者的个体情况（如过敏史等）来选择合适的抗生素种类和剂量。一般来说，口服抗生素疗程可能在 7 - 10 天左右，要严格按照医嘱按时服药，避免自行停药导致感染复发。
抗真菌药治疗
对于真菌引起的交叉感染，在局部治疗效果不佳时，也可以考虑口服抗真菌药物，如伊曲康唑。但口服抗真菌药可能会有一些副作用，比如对肝脏功能有一定影响，所以在服药期间需要定期检查肝功能。
手术治疗
切开引流
当甲沟炎交叉感染形成脓肿时，就需要进行切开引流。这是一种比较有效的治疗手段，医生会在局部麻醉下，用手术刀在脓肿波动感最明显的部位切开一个小口，让脓液排出。之后用生理盐水冲洗伤口，放置引流条，以保证脓液能够持续排出。这种手术可以有效缓解局部的压力和疼痛，促进炎症的消退。
拔甲手术
如果甲沟炎反复发作，指甲已经严重变形嵌入周围组织，引起反复交叉感染，可能需要进行部分或全部拔甲手术。在手术过程中，医生会先对指甲周围进行局部麻醉，然后将嵌入肉中的指甲部分或全部拔除。术后需要注意伤口护理，避免再次感染，新指甲一般会在几个月内逐渐生长出来。
在治疗甲沟炎交叉感染期间，还需要注意保持局部清洁干燥，避免穿过紧的鞋子，减少对患趾（指）的挤压，防止交叉感染进一步扩散。